Μόλις μεταδοθεί ο ιός, υπάρχει μια φάση όπου το μολυσμένο άτομο δεν δείχνει σημάδια. Αυτό ονομάζεται φάση σιωπηλός, και το τελευταίο διαρκεί μεταξύ 2 και 21 ημερών. Κατά τη διάρκεια αυτής της περιόδου, είναι αδύνατο να εντοπιστεί ο ιός στο αίμα επειδή είναι πολύ χαμηλός και το άτομο δεν μπορεί να αντιμετωπιστεί.

Τότε εμφανίζονται τα πρώτα κύρια συμπτώματα της νόσου του ιού Έμπολα. Τα πέντε πιο εμφανή συμπτώματα είναι:

• Η ξαφνική έναρξη έντονου πυρετού, που συνοδεύεται από ρίγη.
• Διάρροια;
• Εμετοί
• Εξαιρετικά έντονη κόπωση.
• Σημαντική απώλεια όρεξης (ανορεξία).

Μπορεί να υπάρχουν και άλλα σημάδια:

• πονοκέφαλο;
• μυϊκοί πόνοι?
• πόνος στις αρθρώσεις;
• αδυναμίες?
• ερεθισμός του λαιμού
• κοιλιακό άλγος;

Και σε περίπτωση επιδείνωσης:

• βήχας;
• εξάνθημα;
• πόνος στο στήθος.
• Κόκκινα μάτια;
• νεφρική και ηπατική ανεπάρκεια
• εσωτερικές και εξωτερικές αιμορραγίες.